Анализ связывания биологически активных соединений с нуклеиновыми кислотами
ВведениеОписание связывания лигандов с нуклеиновыми кислотамиРешёточная модель адсорбцииМодели связывания лигандов на биополимерахСхемы связыванияХарактер взаимодействия между адсорбированными лигандамиВлияние связывания лигандов на состояние матрицыВзаимодействие между матрицами, покрытыми лигандомТермодинамические и математические методыМетод термодинамических потенциалов: подход СкетчардаМетод статистических суммМетоды получения уравнений связыванияКомбинаторный методМетод рекуррентных соотношенийПрименение теории адсорбции для анализа различных ситуаций связывания лигандов с биополимерамиПредставление экспериментальных кривых по СкетчардуПредставление кривых по ХиллуАнализ начального наклона кривых по Гурскому- ЗаседателевуФункции распределенияМодель адсорбцииФункции распределения адсорбированных лигандовСвязывание лиганда, который занимает один реакционный центр матрицыАдсорбция лиганда, который при связывании закрывает несколько реакционных центровНекооперативное связывание протяженного лиганда: подход с помощью метода статистических суммДавление решёточного газаАсимптотический метод анализа изотерм адсорбцииКооперативное связывание. Асимптотический метод анализа изотерм адсорбцииНеконтактные взаимодействия между адсорбированными лигандамиХарактер расположения лигандов на матрицеУравнения адсорбцииАнализ изотерм адсорбцииПотенциал с прямоугольной ямойВзаимодействие лигандов с матрицами НК, имеющими третичную структуруКонтактные взаимодействия между адсорбированными лигандами (два типа комплекса или два лиганда)Система уравнений адсорбцииХарактер расположения лигандов на матрице. Решение уравнений адсорбцииСвязывание лигандов, образующих два типа комплексов с матрицейКооперативные взаимодействия, приводящие к образованию цепочек из лигандов на матрицеКооперативные взаимодействия, приводящие к образованию димеров из адсорбированных на матрице лигандовОбразование димеров, тримеров и тетрамеров при связывании лигандов на матрицеОбразование тримеров при связывании бис-нетропсина на ДНКСвязывание двух разных лигандовКлассификация моделей адсорбции, описывающих связывание лигандов с нуклеиновыми кислотамиТипы взаимодействий между лигандамиТипы изменений, происходящих с матрицамиРасчёт профилей вероятности связывания лигандов с ДНК и анализ диаграмм футпринтингаНеспецифическое связывание протяженных лигандовСпецифическое связывание лиганда с ДНК, несущей заданную последовательность пар нуклеотидовЗаключениеА. Связывание хитозана с ДНКБ. Термодинамические модели, описывающие образование «мостиков» между молекулами нуклеиновых кислот в жидких кристаллахВ. Связывание олигонуклеотидов на микрочипах
