Типы маркеров

Зоолог Э. Майр постулировал, что организмы обладают уникальным свойством, которое отличает их от неживых субъектов: у них есть генотип и фенотип. Когда мы классифицируем организмы, классификация по фенотипу - это только первый шаг. В качестве второго шага мы пытаемся сделать заключение о генотипе - созданной в процессе эволюции генетической программе, которая имеет большую познавательную и прогностическую ценность, чем фенотип. Фенотипы могут обладать разного рода сходствами, нс относящимися к делу, и только анализ логически оцененного генотипа позволяет нам установить, какие сходные черты фенотипа обусловлены конвергенцией, а какие - выражением генотипов предков [20].

Изначально для целей классификации и систематизации, равно как и для изучения биологического и генетического разнообразия, использовались морфологические признаки (например, строение цветка у покрытосеменных, крыльев у насекомых и т. п.). Несомненным преимуществом такого подхода является его простота. Однако при его использовании возникали некоторые затруднения: как следует относиться ко всему множеству морфологических признаков - следует ли их ранжировать по значимости и учитывать лишь наиболее важные или необходимо использовать максимально возможное их число без ранжирования (метод многовариантного анализа) [21].

С развитием методов современной биологии стало ясно, что фенотипические различия лишь отражают различия на генетическом уровне, при этом «искажая» их: ведь на проявление фенотипа влияют не только генетический материал, но и условия среды [21]. Так были разработаны различные типы молекулярных маркеров.

Молекулярные маркеры для паспортизации биологических объектов

Молекулярные маркеры представляют собой низкомолекулярные молекулы вторичных метаболитов, белки с известной последовательностью аминокислот или полинуклеотиды (молекулы ДНК) с определенной структурой и наследуемостью [21-25] (рис. 1).

Молекулярные маркеры

Биохимические

На основе нуклеиновых кислот

Изо- Вторичные ферменты метаболиты

днк-

основанные

РНК-основанные

Основанные на гибридизации

Основанные на

ПЦР

RFLP

Satelite

Targeted Фрагментный (анонимный ) полиморфизм

EST —

SCAR —

RAPD

SSR

STS

AFLP

SSAP

ISSR

SRAP и др.

Рис. 1. Схема молекулярных маркеров, используемых для документирования ботанических коллекций

 
Посмотреть оригинал
< Пред   СОДЕРЖАНИЕ ОРИГИНАЛ   След >